一对一指导 ，包教会，系统学单细胞测序、chipseq、RNAseq、Atacseq、R语言）线上会议 10月5日开始
发布时间：2021-09-19 11:33:00来源：生物通
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我们承诺
1，包教会，学不会一直免费学，直到您完全学懂、学会、学透彻毕业
2，课后建群有完善的一对一指导服务，保证解决每个学员的所有问题
3，学期2个月，每周二四六晚上上课，其余时间老师一对一辅导
4，赠送视频供课后复习
①
课程特色
1，学生信一次报班从此以后再也不用东拼西凑反复报名各类培训班，
2，系统学生信，一次学到位，包教包会。
3，二个月从零基础开始，精细化讲解将生信内容全部学懂（理解）、学会（会敲代码分析）、学透彻（站在顶层设计角度理解）、学以致用（用到自己的标书申请和文章发表中）
②
授课老师
华哥：中山大学博士指导过多篇CNS文章生信分析参与多项国自然重点、国家重大专项、孔雀计划等项目申报有多年生信教学经验，学员遍布协和、华西、湘雅、瑞金、中山医等著名医院
③
学习目标和效果
1，两个月精细化讲解将生信内容全部学懂（理解）、学会（会敲代码分析）、学透彻（站在顶层设计角度理解）、学以致用（用到自己的标书申请和文章发表中）
2，学不会一直学，直到学会才毕业
④
课程安排
（每周二四六晚上7点00开始每晚三个多小时）
第一节课：r语言基础学习包括r和rstudio的安装、环境配置、数据结构等基础内容学习
第二节课：在实战中进一步提升对r语言的学习，主要以geo的芯片数据下载、整理、分析为主。
第三节课：芯片数据分析（主要系统指导如何使用geo数据库画生存曲线，以及无进展、无疾病、多分组的的生存曲线画图，包括热图火山图箱线图小提琴图）
第四节课：rnaseq数据分析（包括系统讲解主流的Deseq2、Edger、limma-voom三种差异分析的方法）
第五节课：基因集富集分析gsvagseakegggo富集包括自定义基因集的富集分析以两篇nature子刊文章为例，系统讲解如何进行参数调整得到符合文章趋势的富集结果
第六节课：tcga数据下载整理差异分析结果画图展示
第七节课：非监督共识聚类算法系统讲解以两篇cell文章为例通路分组的生存曲线转录因子富集
第八节课：wgcna算法系统讲解以nature文章为例，系统讲解三种免疫浸润的算法，以及三种算法的具体应用场景和区别以及参数调整技巧
第九节课：单细胞数据读取以nature文章为例，创建seurat对象质控s4对象的数据结构的系统讲解
第十节课:继续以nature文章为例系统阐释降维、聚类等概念，细胞亚群注释三种方法
第十一节课：多个样本整合的单细胞数据分析包括锚定和harmony两种主流的单细胞数据整合算法，同时讲解多线程运算原理和实操。
第十二节课：单细胞差异分析metadata理解分组添加可视化画图热图气泡图
第十三节课：以nature文章为例系统auc算法计算通路活性，单细胞差异基因的富集分析gsea亚群的gsvaauc转录因子预测
第十四节课：系统讲解拟时间分析包括monocle2和monocle3做3d拟时间
第十五节课：系统讲解scenic算法转录调控网络分析
第十六节课：系统讲解cellphonedb、cellchat、italk三种主流分析细胞互作的软件
第十七节课：infercnv和以cell文章为例的自定义算法的染色体拷贝数变异
第十八节课：单细胞非负矩阵cnn降维非共识聚类以及单细胞的wgcna
第十九节课：以cell文章为例系统讲解单细胞的RNAvelocity应用
第二十节课：系统学习linux操作系统chipseq全流程分析以nature文章为例包括质控上数据比对、MACS2、IGV进行可视化
第二十一节课：chipseq下游的motif富集不同处理直接的峰值overlap韦恩图差异paek寻找peak注释以cell文章为例超级增强子寻找
第二十二节课：Atacpseq全流程分析包括MappingQC、多个重复样本合并、Peakcalling、bedGraphToBigWig、TSSEnrichment、bedtools计算overlap、IDR评估、可视化。
第二十三节课：RNAsea的上游分析（去接头、质控、比对、定量）+芯片原始数据分析（质量控制、背景校正、归一化处理）
第二十四节课：纯生信文章代码复现，将教学内容学有所用，练习提升
第二十五节课：以优秀标书为例，讲解如何将所学生信分析应用于国自然标书申请+课程大总结
会务时间
（1）2021年10月5日-12月5日（学期两个月）
（2）授课方式腾讯线上
（3）晚上：7:00-10:00
联系方式
联系人：谢老师13611825136
报名邮箱：wybiot@126.com
主办单位
玮瑜科研平台
承办单位
上海玮瑜生物科技有限公司
上海焦务科技服务中心
会务费用
（1）费用：8800元/人
（2）发票名目：可开会务费、会议费、注册费、检测费、统计分析服务费等发票。
汇款账号
A：汇款账户
账户名称：上海焦务科技服务中心
账户号：97340078801200000311
开户行：上海浦东发展银行大华支行
B：支付宝转账
收款人：wybiot@163.com支付宝户名:上海玮瑜生物科技有限公司
C：信用卡或公务卡支付
微信或支付宝扫描二维码支付，通过信用卡/公务卡扣款
报名方式
报名方法一：邮箱报名：编辑您的姓名、手机号码参加班级发送到wybiot@126.com
报名方法二：在线报名：（长按识别或扫描下图二维码报名）
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